El juego se desarrolla en la ficticia isla de Auroa, en el Océano Pacífico. A grandes rasgos, de trata de un entorno de mundo abierto, el cual ofrece al jugador una gran libertad para vagar, explorar y aventurarse por donde desee.

El jugador asume el personaje del Teniente Coronel Anthony ‘Nomad’ Perryman, un agente de las fuerzas especiales.

Perryman ha sido enviado a la isla para investigar una serie de incidentes que parecen estar relacionados con la misteriosa empresa contratista militar, Skell Technology. La jugabilidad se desarrolla principalmente desde una perspectiva en tercera persona, con ocasionales saltos a la perspectiva de primera persona que buscan generar un mayor efecto dramático, además de facilitar el uso de la mira al utilizar las armas de tiro. Cuando Perryman descubre que el principal antagonista es en realidad un antiguo integrante del equipo Ghost, el riesgo de la misión aumenta y el agente se percata de que deberá luchar por su vida.

Este juego dificulta mucho más las cosas para aquellos jugadores que gustan atravesar los escenarios con un estilo de juego discreto y tienden a quedarse al margen de la acción, evadiendo los combates y tomando el camino largo para evitar el fragor de la batalla. La Inteligencia Artificial de los enemigos ha sido mejorada para que los oponentes respondan a las acciones del jugador de una manera más orgánica, y no al clásico estilo de ‘ojo por ojo…’ Además, las patrullas realizan recorridos periódicos en ‘busca’ del jugador, lo cual aumenta la posibilidad de que se desaten batallas repentinas.

Pero esto no significa que en algunas ocasiones no puedas evadir peligros tomando algunas medidas de sigilo: ¡podrás cortar algunas vallas y aprovechar las maravillosas opciones de camuflaje pasa salirte con la tuya!